Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATA5Q9BWX5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms