Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2BQ9BVA1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms