Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAGR1Q9BTK6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms