Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UPK3BQ9BT76 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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