Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
PMCHL2Q9BQD1 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms