Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms