Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PITX2Q99697 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms