Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD9AQ99638 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms