Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS8Q99627 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms