Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRIQ1Q96JM4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRIQ1Q96JM4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms