Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NXNL1Q96CM4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms