Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ULK4Q96C45 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ULK4Q96C45 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms