Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RNF34Q969K3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms