Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GATA6Q92908 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GATA6Q92908 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms