Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TTC29Q8NA56 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TTC29Q8NA56 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms