Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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USP34Q70CQ2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
USP34Q70CQ2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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USP34Q70CQ2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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USP34Q70CQ2 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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USP34Q70CQ2 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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USP34Q70CQ2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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USP34Q70CQ2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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USP34Q70CQ2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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USP34Q70CQ2 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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USP34Q70CQ2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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USP34Q70CQ2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
USP34Q70CQ2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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