Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MFSD6Q6ZSS7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms