Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRC1

C4orf50, Uncharacterized protein C4orf50, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf50Q6ZRC1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf50Q6ZRC1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms