Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMBR1LQ6UX01 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMBR1LQ6UX01 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms