Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DUX4L9Q6RFH8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms