Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NEK5Q6P3R8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms