Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 CACNA1C-IT3-201ENST00000542680 622 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 RN7SL87P-201ENST00000497657 288 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEP350Q5VT06 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms