Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNT1Q5JUK3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNT1Q5JUK3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms