Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MCPH1-207ENST00000522905 2049 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms