Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LETM2Q2VYF4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms