Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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ECM1Q16610 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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ECM1Q16610 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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ECM1Q16610 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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ECM1Q16610 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ECM1Q16610 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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