Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SSX1Q16384 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SSX1Q16384 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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