Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ZNF56Q15929 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms