Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIP10Q15642 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms