Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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NCF4Q15080 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NCF4Q15080 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NCF4Q15080 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NCF4Q15080 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NCF4Q15080 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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NCF4Q15080 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NCF4Q15080 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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