Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMC1AQ14683 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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