Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TUBB2AQ13885 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms