Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEUROD1Q13562 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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