Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PLD1Q13393 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLD1Q13393 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms