Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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SCGB2A2Q13296 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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SCGB2A2Q13296 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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SCGB2A2Q13296 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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SCGB2A2Q13296 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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SCGB2A2Q13296 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SCGB2A2Q13296 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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