Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NME3Q13232 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NME3Q13232 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME3Q13232 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME3Q13232 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME3Q13232 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME3Q13232 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME3Q13232 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME3Q13232 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME3Q13232 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME3Q13232 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME3Q13232 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NME3Q13232 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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NME3Q13232 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NME3Q13232 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME3Q13232 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NME3Q13232 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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