Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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