Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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STRN3Q13033 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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STRN3Q13033 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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STRN3Q13033 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
STRN3Q13033 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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