Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK3Q13003 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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