Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms