Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EFEMP1Q12805 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms