Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOX4Q06945 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms