Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PSME1Q06323 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PSME1Q06323 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms