Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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IRF8Q02556 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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IRF8Q02556 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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IRF8Q02556 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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IRF8Q02556 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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IRF8Q02556 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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IRF8Q02556 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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IRF8Q02556 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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IRF8Q02556 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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IRF8Q02556 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IRF8Q02556 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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