Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms