Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CDC42EP1Q00587 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms