Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ASIC1P78348 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms