Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1P60507 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms