Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COPAP53621 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPAP53621 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPAP53621 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPAP53621 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms