Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THOP1P52888 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THOP1P52888 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THOP1P52888 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THOP1P52888 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THOP1P52888 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THOP1P52888 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THOP1P52888 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THOP1P52888 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THOP1P52888 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
THOP1P52888 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
THOP1P52888 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
THOP1P52888 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
THOP1P52888 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms